Với những chuyên biệt để thích nghi với điều kiện sinh thái, nhiều loài thực vật đã có những biến đổi phần thân mang các chức năng đặc biệt.

• Thân ngầm: Hình thái thân cây này chủ yếu nằm ẩn dưới mặt đất, đại diện cho thực vật là các phần thân khí sinh. Có thể thân này là bộ phận dự trữ chất dinh dưỡng chủ yếu (dong, giềng), nhiều khi chỉ đóng vai trò phân nhành khí sinh (tre, trúc).
• Thân củ: Khoai tây, su hào, Khoai môn,củ hành, khoai mì,cà rốt
• Thân hành: Các loài Thủy tiên, Hành, Tỏi,...
• Thân mọng nước: Xương rồng,...
• Thân rễ: dong ta, gừng, nghệ, cỏ tranh,....
• Giò thân: củ cải, củ từ,...
• Cành hình lá: cây quỳnh, càng cua,....
• Gai: mọc ở nách lá do cành biến đổi làm nhiệm vụ bảo vệ thân như chanh, bưởi,....